核糖核酸干擾 (RNA interference ,RNAi) 被廣泛應用在渦蟲相關研究,其中一種進行 RNAi 的方法是以餵食渦蟲雙股 RNA (dsRNA)達到 RNAi 的目的,但 dsRNA 如何從渦蟲腸道進入組織中的機轉尚不明確。本研究選擇 tgs1 為目標基因,利用 RT-qPCR 檢測 tgs-1 的表現量,探討餵食 dsRNA 在東亞渦蟲的 RNAi 作用機制與效率。
1. 探討 dsRNA 不同的餵食次數對渦蟲 RNAi 效果的影響
2. 探討不同長度的 dsRNA 對渦蟲 RNAi 效果的影響。
3. 探討對渦蟲 tgs-1 基因進行 RNAi 後對其他基因的影響
4. 探討渦蟲體內與線蟲 SID-1 同源基因的功能保守性
本研究實驗發現,6 次的 dsRNA 餵食比餵食 2 次或 4 次有效率,而且餵食的 dsRNA 長度在縮短至 500 個核苷酸後對 RNAi 效率沒有顯著影響;tgs-1 的基因緘默作用同時會少量增加 Ago2 的表現量,明顯提升 gata 的表現量,並且降低 piwi-1 表現量,而這些基因與 RNAi 的機制和dsRNA 的攝入量有關。除此之外,透過生物資訊學的胺基酸序列比對發現渦蟲與線蟲 SID-1 同源基因具有相當高的相似度,未來將進一步探討SID-1 蛋白在渦蟲 RNAi 所扮演的角色。